В результате первой подачи воды, а так же сильных степных ветров, в Ленинский магистральный канал попадает значительное количество «Перекати поле» (Перекати́-по́ле — травянистое растение, произрастающее в степных или пустынных районах, оставляющее после отмирания особые образования, круглые, овальные и сухие, которые состоят из высохших частей и катаются по ветру в виде иногда довольно больших шаров).

Для предотвращения засоров и стабильной работы Ленинского магистрально канала проводится постоянный мониторинг и устранение скоплений растительный остатков.