Строительство оросительной системы было начато в 1958 году, а в 1963 году было организовано Управление Райгородской оросительно-обводнительной системы .
С 1 апреля 1973 года Райгородская оросительно-обводнительная система была переименована в Головное управление эксплуатации оросительно-обводнительной системы.
С 1 декабря 1978 года переименована в Управление Светлоярской оросительно-обводнительной системы.
С 1 апреля 1986 года Управление Светлоярской оросительно-обводнительной системы было объединено со Светлоярской ПМК и названо Светлоярским районным производственным ремонтно-эксплуатационным объединением.
С 1 апреля 1997 года СРПРЭО было переименовано в районное госучреждение по эксплуатации оросительных систем.
С 15 апреля 2002 года Светлоярский Райводхоз был переименован в Светлоярский филиал ФГУ «Управление «Волгоградмелиоводхоз».
С 1 февраля 2006 года к Светлоярскому филиалу ФГУ «Управление «Волгоградмелиоводхоз» присоединён Калачёвский филиал, в дальнейшем Калачёвский участок №3.
Калачёвский участок находится в п. Береславка Калачёвского района. Участок обслуживает орошаемые земли ООО «Агрофарм» , КФХ и личные подсобные хозяйства.
Светлоярский филиал ФГУ «Управление «Волгоградмелиоводхоз» переименован в Светлоярский филиал ФГБУ «Управление «Волгоградмелиоводхоз» на основании приказа № 190 от 05.08.2011 года.
Первым начальником в управлении был Кожарский Владимир Макарович.